大球盖菇目前生产上应用的品种主要是从国外引入的菌株，品种较少，各地由于气候条件不同，也选育分离出一些的民间种源。如：黑龙江省倪淑君老师培育出“黑农球盖菇 1 号”是比较适于北方寒地栽培的优良品种。吉林省到目前为止还没有自己的品种。选择了优良菌株只是走完了第一步，更关键的是掌握制种技术，严格按照操作规程操作，才能生产出优良的菌种，获得好的栽培效果。

菌种保藏的方法：①斜面低温保存法：将斜面菌种，置于 4℃冰箱保存，以后每隔 2～3 个月转管移接一次。②液体石蜡保存法：注入一层已灭过菌的液体石蜡，使菌种与空气隔绝，降低其新陈代谢的活动，然后在棉塞外包以塑料薄膜，一般可保存一年以上。③木屑试管菌种保存法：用杂木屑按原种的培养基配制装入大号试管，容量为管高的 2/3，擦净管口塞紧棉塞，用牛皮纸包扎管口后高压灭菌，然后移入母种，在 25～28℃下培养，待长满菌丝后，立即移到低温干燥环境保存、或埋于尿素、硝酸铵或地洞中保存，效果更好，并能延长保存时间。④冷冻干燥保藏法：这种方法采用真空、干燥、低温等手段，使菌种新陈代谢活动处于相对静止状态，在低温下快速冷冻，又在低温下真空干燥，而使菌细胞的结构与成分保持原来状态而保存菌种。

此外，还有沙土保存法、液氮超低温保藏法、滤纸片保存法、菌丝球生理盐水保藏法、麦粒保藏法、干孢子真空保藏法等。纯化培养：待平板中菌丝萌发，长到 1.5~2.5 厘米时进行菌种纯化，将长好的菌丝尖端培养基迅速转入准备好的试管中进行培养。特别注意：组织分离后得到的母种，必须经过出菇试验才能在生产中使用。